宋曉峰

作者: 審核人: 訪問量:7506發布時間:2018-09-06
宋曉峰
姓名:宋曉峰性别:職務:副院長
職稱:教授導師類别:博士生導師辦公室:江甯校區東區伟德 官网2号樓408
研究領域:一 目前本課題組主要采用計算系統生物學研究手段研究人類複雜疾病的分子調控機制。
1、針對基因組測序數據進行緻病基因及其突變的篩選與分析;
2、針對轉錄組測序數據進行癌症特異基因的差異表達分析,預測新轉錄本;
二 大數據分析與數據挖掘
1.生物大數據分析的算法設計;
2.生物醫學網絡應用程序與數據庫的開發;

電話:Email:xfsong@nuaa.edu.cn
個人簡介

宋曉峰 博士,南京航空航天大學,伟德 官网生物醫學工程系,教授,博士生指導教師,江蘇省生物醫學工程學會理事,2013年度江蘇省“六大人才高峰”人才項目培養對象。主要研究領域為基因組學與計算系統生物學。近幾年主持國家自然科學基金兩項、江蘇省自然科學基金一項,教育部博士點基金一項,江蘇省“六大人才高峰”項目一項,主持校級教改項目三項,以第一作者或通訊作者在國際著名SCI檢索學術期刊Nucleic Acids Research, Journal of Theoretical Biology, Journal of Medical Virology, BMC Genomics等發表論文28篇,EI、ISTP收錄論文30多篇,獲發明專利授權2項,軟件著作權一項。多次參與組織和參加國内國際學術會議。目前擔任:中國人工智能學會生物信息學與人工生命專業委員會委員;中國計算機學會生物信息學專委會委員;江蘇省生物醫學工程學會理事;江蘇省生物醫學工程學會生物信息學專業委員會副主任委員。

 

 

學術成果

以第一作者或通訊作者在國際著名SCI檢索學術期刊Nucleic Acids Research, Journal of Theoretical Biology, Journal of Medical Virology, BioSystems等發表論文28篇,EI、ISTP收錄論文30多篇。

1.Xiaofeng Song, Naibo Zhang, Ping Han, Rose K. Lai, Kai Wang, Wange Lu. Circular RNA Profile in Gliomas Revealed by Identification Tool UROBORUS. Nucleic Acids Research.2016,44(9):e87. (SCI IF#10.162).

2.Xiaobai Zhang, Juan Cui, Daniel Nilsson; Kapila Gunasekera; Isabel Roditi; Astrid Chanfon; Xiaofeng Song, Huinan Wang, Ying Xu and Torsten Ochsenreiter. The Trypanosoma brucei Mitocarta and its Regulation and Splicing Pattern during Development. Nucleic Acids Research.2010,38(21):7378-7387. (SCI#689TK, IF#10.162)

3.Minghao Wang, Xiaofeng Song,Ping Han, Wei Li, Bin Jiang. New syntax to describe local continuous structure-sequence information for recognizing new pre-miRNAs. Journal of Theoretical Biology. 2010,264(2):578-584.(SCI# 588GG, IF#2.738)(corresponding author)

4.Kun Sun, Xiaona Chen, Peiyong Jiang, Xiaofeng Song, Huating Wang, and Hao Sun. iSeeRNA: identification of long intergenic non-coding RNA transcripts from transcriptome sequencing data. BMC Genomics. 2013,14(Suppl 2):S7.(corresponding author)(SCI IF# 4.3)

5.Xiao-feng Song,Ping Han,Yi-Ping Phoebe Chen. Genetic variation of the hemagglutinin of avian influenza virus H9N2. Journal of Medical Virology. 2011,83(5):838-846.(SCI#736BL, IF# 2.572)

6.Xiaofeng Song; Minghao Wang; Yi-Ping Phoebe Chen; Ping Han; Hao Sun. Prediction of pre-miRNA with multiple stem-loops using pruning algorithm. Computers in Biology and Medicine. 2013 Jun 1;43(5):409-416.(corresponding author)(SCI, IF#1.485)

7.Xiaofeng Song,Lei Cheng, Tao Zhou, Xuejiang Guo, Xiaobai Zhang, Ping Han, Yi-ping Phoebe Chen, Jiahao Sha. Predicting miRNA-Mediated Gene Silencing mode based on miRNA-target Duplex Features. Computers in Biology and Medicine. 2012, 42(1):1-6. (SCI, IF#1.485)

8.Xiaobai Zhang. Xiaofeng Song, Huinan Wang。Characteristic comparison between two types of miRNA precursors in metazoan species。BioSystems,2010,100(2):144-149. (SCI# 599MX, IF#1.653)(corresponding author)

9.Xiaofeng Song, Hao Jia,Tao Zhou, Xuejiang Guo, Ping Han, Xiaobai Zhang and Jiahao Sha. SProtP: a web server to recognize those short-lived proteins based on sequence-derived features in human cells. PLoS ONE.2011, 6(11): e27836. (SCI, IF#4.78)

10.Xiaofeng Song, Wei-min Chen, Yi-Ping Phoebe Chen, Bin Jiang. Candidate Working Set Strategy based SMO Algorithm in Support Vector Machine. Information Processing & Management. 2009,45(5): 584-592. (corresponding author)(SCI# 481FP, IF# 2.106)

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

承擔項目

1.主持國家自然科學基金(No.61171191);

2.主持國家自然科學基金(No.61571223);

3.主持教育部博士點基金(博導類,No.20133218110016);

4.主持2013年江蘇省“六大人才高峰”項目(No.SWYY-021)

5.主持江蘇省自然科學基金(BK2010500);

6.主持校級教改項目三項;

 

 

 

 

 

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